Czasopismo | PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY | Rocznik 2012 - zeszyt 3a

Alternative colour space construction of the stain reaction in FISH image analysis for quantification of the HER2 gene amplification

nr katalogowy: 66542

The paper presents a study of the different colour representation (intensity of the stain reaction) in FISH images. The better colour visualisation of the centromers and HER2 genes in these methods of the breast cancer stain has a significant influence to correct evaluation of the presence/absence HER2 gene amplification. We taken into account wide range of the image colour representation and propose alternative colour space construction, based on the selected signals in FISH image registration. The proposed approach offers the reduction of the angle between HER2 dots from about 10º to 5.5º. Streszczenie. Artykuł prezentuje analizę różnych reprezentacji barwnych obrazów FISH. Lepsza wizualizacja barwna centromerów i genów HER2 w rozważanym barwieniu preparatów raka sutka ma znaczący wpływ na prawidłowość oceny obecności bądź braku amplifikacji tego genu. W badaniu przeanalizowano wiele reprezentacji barw oraz zaproponowano alternatywny sposób konstrukcji przestrzeni barw, poprzez użycie wybranych sygnałów z rejestracji obrazów FISH. Zaproponowane podejście pozwala zmniejszyć kąt przestrzenny pomiędzy poszczególnymi znacznikami genów HER2 z wartości około 10º do 5.5º. (Alternatywne przestrzenie barw w analizie obrazów FISH w analizie ilościowej amplifikacji genu HER2) Keywords: colour representation, FISH, breast cancer. Słowa kluczowe: reprezentacja barw, FISH, rak sutka. Background Fluorescent in situ hybridization (FISH) is a valuable method for determining HER2/neu status in breast cancer. The over-expression of HER2 oncogene is presents in approximately 20-40% of breast cancer cases giving an indication to trastuzumab therapy. The analysis of the FISH microscopic images requires the recognition of the separate cell nuclei and green and red dots inside them, represent the 17th centromers (CEP-17) and HER2 genes in the chromosomes. The amplification was considered if the ratio HER2/CEP-17 was >2.0. The microsco[...]

Jeśli masz wykupiony/przyznany dostęp - zaloguj się. Skorzystaj z naszych propozycji zakupu!

Publikacja


e-Publikacja (format pdf) - nr 66542 "Alternative colour space ..." licencja: Osobista Produkt cyfrowy	10.00 zł

Zeszyt


PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - e-zeszyt (pdf) 2012-3a licencja: Osobista Produkt cyfrowy	55.00 zł

Prenumerata

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - prenumerata cyfrowa
licencja: Osobista

Produkt cyfrowy
Nowość

762.00 zł

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - PAKIET prenumerata PLUS
licencja: Osobista

Szczegóły pakietu

Nazwa
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - PAKIET prenumerata PLUS (Prenumerata papierowa + dostęp do portalu sigma-not.pl + e-prenumerata)	1002.00 zł brutto 927.78 zł netto 74.22 zł VAT (stawka VAT 8%)

1002.00 zł

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - papierowa prenumerata roczna + wysyłka
licencja: Osobista

Szczegóły pakietu

Nazwa
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - papierowa prenumerata roczna	960.00 zł brutto 888.89 zł netto 71.11 zł VAT (stawka VAT 8%)
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - pakowanie i wysyłka	42.00 zł brutto 34.15 zł netto 7.85 zł VAT (stawka VAT 23%)

1002.00 zł

Zeszyt

2012-3a

Twój Koszyk

Publikacja

Zeszyt

Prenumerata

Zeszyt

Czasopisma