Czasopismo | PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY | Rocznik 2011 - zeszyt 5

Comparison of single and sequential thresholding applied to segmentation of a cell cluster at Ki-67 staining

Tomasz MARKIEWICZ

nr katalogowy: 59964

The paper presents the comparison of different approaches to segmentation of a cell cluster in microscopic images at Ki-67 stained tissues. In automatic quantitative analysis appropriate cell segmentation is the most important task. The main problem is a cell bordering or overlapping, which makes different cell clusters very difficult to separate. Different types of cells based on all nuclei can be recognized. Among them there exists bordering with lighted area between nuclei, the bordering without that area but with significant narrow space between nuclei and in the bad case without even this narrow space. In the first case the optimal selection of threshold value, also in the sequential thresholding manner, can be a successful approach. For nuclei bordering with significant narrow border the appropriate distance transformation and the watershed transform is the most common method to separate these cells. The advantages and disadvantages of different approaches to segmentation will be presented and discussed in the study. Streszczenie. W pracy przedstawione jest porównanie różnych metod segmentacji klastrów komórek w obrazach mikroskopowych przy odczynie Ki- 67. Jest to obok klasyfikacji komórek główny problem występujący w automatycznej analizie ilościowej preparatów tkanek. Klastry komórek są obiektami obrazu bardzo trudnymi do właściwej segmentacji i związane są ze stykaniem lub nakładaniem się profili jąder komórek. Można odróżnić kilka rodzajów klastrów: z jaśniejszym obszarem pomiędzy jądrami komórek, bez takiego obszaru ale z przewężeniem powierzchni oraz w najtrudniejszym przypadku bez przejaśnień i przewężeń. W pierwszym z wymienionych przypadków skutecznym podejściem jest odpowiedni wybór progu do progowania, w tym podejście oparte na progowaniu sekwencyjnym. W drugim przypadku dobre efekty daje metoda działów wodnych w połączeniu z właściwą transformacją odległościową. Skuteczność rozważanych w pracy podejść segmentacji klastrów k[...]

Jeśli masz wykupiony/przyznany dostęp - zaloguj się. Skorzystaj z naszych propozycji zakupu!

Publikacja


e-Publikacja (format pdf) - nr 59964 "Comparison of single and ..." licencja: Osobista Produkt cyfrowy	10.00 zł

Zeszyt


PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - e-zeszyt (pdf) 2011-5 licencja: Osobista Produkt cyfrowy	55.00 zł

Prenumerata

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - prenumerata cyfrowa
licencja: Osobista

Produkt cyfrowy
Nowość

762.00 zł

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - PAKIET prenumerata PLUS
licencja: Osobista

Szczegóły pakietu

Nazwa
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - PAKIET prenumerata PLUS (Prenumerata papierowa + dostęp do portalu sigma-not.pl + e-prenumerata)	1002.00 zł brutto 927.78 zł netto 74.22 zł VAT (stawka VAT 8%)

1002.00 zł

PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - papierowa prenumerata roczna + wysyłka
licencja: Osobista

Szczegóły pakietu

Nazwa
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - papierowa prenumerata roczna	960.00 zł brutto 888.89 zł netto 71.11 zł VAT (stawka VAT 8%)
PRZEGLĄD ELEKTROTECHNICZNY - pakowanie i wysyłka	42.00 zł brutto 34.15 zł netto 7.85 zł VAT (stawka VAT 23%)

1002.00 zł

Zeszyt

2011-5

Twój Koszyk

Publikacja

Zeszyt

Prenumerata

Zeszyt

Czasopisma